ایمن الظواهری یک جراح مصری است، او زمانیکه اسامه بن لادن بعد از حمله یازده سپتامبر توسط نظامیان امریکایی در ابیتآباد پاکستان در نتیجه یک حمله هوایی کشته شد رهبری این شبکه را بر عهده گرفت.
گفته میشود که ایمن الظواهری در مرز میان افغانستان و پاکستان مخفی شده است.
الظواهری خطاب به هواداران خود گفت: "برادران مجاهد من در فلسطین و بقیه امتهای اسلامی باید منافع اسرائیل و همپیمانان آمریکایی، انگلیسی، فرانسوی، روس، اروپایی سراسر جهان را هدف بگیرند".
وی تاکید کرد: اسرائیل و همپیمانانش جهاد در اراضی فلسطینی را سرکوب کرده و در هر جا علیه ما توطئه میکنند و متحد میشوند، ما باید آنها را در هر زمان و در هر مکانی که مناسب میبینیم، تعقیب کنیم.
الظواهری افزود: در شیوههای عملیاتی خود ابتکار عمل به خرج دهید.
در حمله یازدههم سپتامبر ۲۰۰۱که توسط گروه القاعده انجام شد، در حدود ۳۰۰۰نفر در امریکا کشته شدند.