در استعفانامهی خلمی خطاب به رییسجمهور غنی گفته شده است که «به حضور جلالتمآب شما به عرض میرسانم تا نسبت مشکلات صحی استعفای اینجانب را بهحیث معین انرژی و سرپرست وزارت انرژی و آب از تاریخ اول جدی سال ۱۳۹۸ منظور نموده، ممنون سازید تا بتوانم به تداوی خویش بیشتر و بهتر رسیدگی نمایم».
این درحالی است که در یک مکتوب معاونیت حکومتداری و برنامههای ریاست عمومی دفتر مقام عالی ریاستجمهوری عنوانی وزارت انرژی و آب آمده است که آقای خلمی تقاضای رخصتی داشته، اما درخواست او از سوی رییسجمهور غنی رد شده است.
براساس این مکتوب، آقای غنی از محمدگُل خلمی خواسته است که از مقامش کنار برود: «چون بارها رخصتی گرفتهاند و کارهای وزارت در غیاب یک ماه انجام شده نمیتواند. استعفای خویش را تقدیم نمایند.»
این در حالی است که محمدگُل خلمی از سه سال بدینسو بهحیث معین انرژی وزارت انرژی و آب کار میکرد.
او همچنان از حدود یکونیم سال بدینسو، زمانی که علیاحمد عثمانی، وزیر پیشین وزارت انرژی و آب از سوی رییسجمهور غنی برکنار شد، از امور این وزارت سرپرستی میکرد.